Pierwsze schronisko powstało w Bydgoszczy w 1951 roku na leśnych terenach przy ul. Siedleckiej. Egzystowało dzięki determinacji działaczy lokalnego oddziału Towarzystwa Opieki nad Zwierzętami.
Do 1958 roku było finansowane ze skromnych środków tej organizacji; jednak z kłopotami materialnymi i lokalowymi - brakowało pomieszczeń, opieki medycznej, środków higieny, żywności. Zwiększała się natomiast liczba bezdomnych, potrzebujących opieki zwierząt.
W latach 1980-84 udało się znaleźć oraz wstępnie zagospodarować inne, lepsze miejsce - już przy ul. Grunwaldzkiej.
W latach 1984-88 powstała nowa część schroniska; pozostawione w stanie surowym i bez ogrodzenia obiekty niszczały wskutek systematycznej dewastacji
Od 1990 roku do dziś trwają prace nad wykończeniem i uporządkowaniem całości. Najważniejsze etapy to:
- ogrodzenie
- wybudowanie 16 wybiegów dla zwierząt
- wyposażenie Ambulatorium Weterynaryjnego
- skanalizowanie wybiegów w starej części schroniska, wybetonowanie podłoża
- wyposażenie części socjalnej i biur
- pozyskiwanie i kupno kolejnych potrzebnych samochodów
- profesjonalne wyposażenie kuchni
- podłączenie schroniska do kanalizacji miejskiej
- wybudowanie woliery dla kotów
- uporządkowanie zieleni na terenie schroniska, zasadzenie 150 podarowanych drzewek
- założenie estetycznych terenów zielonych
- ogrodzenie nowo przyznanych sektorów schroniska